вторник, 10 апреля 2012 г.

3D-структура фермента подскажет способы разработки новых лекарств

3D-структура фермента подскажет способы разработки новых лекарствМеждународная исследовательская группа решила структуру новой важной мишени для разработки направленных химиотерапевтических средств в комплексе со специально спроектированной синтетической молекулой.

Фермент SHIP2, играющий главную роль в клеточных сигнальных механизмах, участвует в отрицательном регулировании инсулина, чем и привлёк к себе внимание. Как полагают, он напрямую причастен к развитию диабета 2-го типа, ожирения и рака. Предыдущие попытки получить монокристалл SHIP2 в комплексе с его натуральным субстратом провалились. Поэтому учёные из Университета Бата (Великобритания) под руководством профессора Барри Поттера создали новый синтетический ингибитор и совместно с европейскими коллегами, используя метод рентгеновской дифракции, решили структуру ключевой области SHIP2, отвечающей за связывания.

Результаты исследования опубликованы в журнале ACS Chemical Biology (статья находится в открытом доступе).

Используя методы компьютерного моделирования в молекулярной динамике, учёные открыли гибкую область протеина, которая принимает необходимую форму над веществом во время связывания. Они надеются, что полученной информации будет достаточно для разработки дизайна новых малых молекул, надёжно блокирующих SHIP2.

Прекрасный и действительно полезный результат — 3D-структура каталитического центра фермента. Отметим также нетривиальность подхода к решению непростой задачи. Обычное дело — потенциальная мишень (протеин) не желает кристаллизоваться. Тогда стараются подобрать наилучшие условия и пробуют, пробуют, пробуют. Британцы поступили иначе: зная строение природного субстрата для этого фермента, они создали такой лиганд, который, обладая необходимым фрагментом для связывания, способствовал бы кристаллизации получающегося комплекса. И всё получилось, и этот результат не менее важен, чем сама решённая структура, потому что показывает менее удачливым коллегам, как нужно действовать в подобных случаях, ведь без точной информации о центре связывания невозможно создание эффективных ингибиторов.

Подготовлено по материалам Университета Бата.

Оригинальная статья

Поделитесь этой новостью с Вашими друзьями!

Ранее в рубрике "Компьютеры":

Стало известно немного больше о вулканической сантехнике
Два новых исследования в области «сантехнических систем», лежащих под вулканами, возможно, помогут учёным прогнозировать крупные извержения. Международные группы, которые возглавляли специалисты из Университета Лидса (Великобритания), изучили магматические очаги системы срединно-океанических хребтов — огромной цепи вулканов, которая создаёт новую земную кору. Эксперты работали в Афаре (Эфиопия) ...
  (читать дальше)

Компьютерное моделирование заменит химические методы поиска новых лекарств
Учёные из Свободного университета Амстердама (Нидерланды) и их коллеги из Венского университета и Венского медицинского университета (Австрия) получили новую информацию о молекулярном базисе рецепторов GABAA (ГАМК) — важном классе рецепторов мозга, участвующих в регулировании уровня возбуждения нервных клеток. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature Chemical Biology. GABAA-рецептор...
  (читать дальше)

Вживляемые микросхемы для бионического глаза прошли лабораторные испытания
Бионический глаз давно не новинка, однако до сих пор ему сопутствуют проблемы, в частности существенная сложность непосредственной передачи визуальной информации от камер в мозг. Исследователи из Университета Монаша (Австралия) полагают, что к 2014 году они решат этот вопрос раз и навсегда. Австралийские исследователи только что провели первые лабораторные испытания новой системы вживляемых микр...
  (читать дальше)

Место для гигантского радиотелескопа SKA пока так и не выбрали
Гигантский радиотелескоп SKA (Square Kilometre Array), самый амбициозный и поражающий воображение международный проект нашего времени, так и не получил прописку. 3 апреля на заседании в Амстердаме совет директоров SKA вопреки ожиданиям отложил вопрос о том, где строить этот супертелескоп. Главная проблема здесь – в потрясающих воображение размерах SKA. Ядро телескопа будет состоять из трех тысяч ...
  (читать дальше)

Новый алгоритм позволяет создать недорогой «умный песок», способный принять любую форму
Алгоритм, предложенный в Массачусетском технологическом институте (США), может сделать доступными любые количества «умного песка», способного принять любую форму, позволяя быстро создавать новые орудия или менять требующие ремонта части любой машины. По сути, речь идёт о роботе, состоящем из множества автономных переконфигурируемых элементов, эдаком «песочном человеке» Брэдбери. В Лаборатории ин...
  (читать дальше)

Веб-хранилище Google предложит 5 Гб бесплатного дискового пространства
Ресурс TalkAndroid обнародовал, предположительно, скриншот главной страницы «облачного» хранилища данных Google. Новая служба якобы получит название Google Drive. Судя по опубликованному изображению, сервис предложит подписчикам 5 Гб бесплатного дискового пространства, а не 1 Гб, как сообщалось ранее. Аккаунты большего объёма, по всей видимости, будут предоставляться на платной основе. Сообщае...
  (читать дальше)

Eken A90: бюджетный планшет с 9,7-дюймовым экраном
Компания Eken выпустила недорогой планшетный компьютер A90 на платформе Android 4.0 Ice Cream Sandwich. В новинке применён ARM-процессор с тактовой частотой 1,2 ГГц. Объём оперативной памяти может составлять 512 Мб или 1 Гб; вместимость интегрированного флеш-модуля — 4, 8 или 16 Гб. Сенсорный экран, изготовленный по ёмкостной технологии, имеет диагональ 9,7 дюйма; его разрешение — 1024×768 точек...
  (читать дальше)

Ubi-Camera: фотокамера без дисплея и видоискателя
Сотрудники японского Института передовых медиаискусств и наук (IAMAS) разработали прототип необычного фотоаппарата, названного Ubi-Camera. Устройство не имеет ни дисплея, ни видоискателя. Для того чтобы понять, как будет выглядеть снимок, нужно сформировать прямоугольную рамку из указательных и больших пальцев рук, как это часто делают фотографы. Приближая и удаляя рамку от лица, можно осуществл...
  (читать дальше)

Dell прекращает продажи смартфонов в США
Компания Dell решила свернуть продажи коммуникаторов на американском рынке в связи с «окончанием их жизненного цикла». Dell вышла на рынок смартфонов США в августе 2010 года с моделью Aero и гибридом «умнофона» и мини-плланшета Streak 5. Позднее появился коммуникатор Venue Pro под управлением Windows Phone 7 и «гуглофон» Venue. Сейчас эти аппараты предлагаются также в Южной Корее и Индии. В De...
  (читать дальше)
НАСА и ЕКА будут осваивать Марс в четыре этапа
Группа учёных из Европы, Канады и США, включая специалистов НАСА и ЕКА, выделила четыре главных требования к будущим проектам, посвящённым доставке образцов марсианского грунта на Землю. Во главу угла поставлены поиск следов прошлой или нынешней жизни. Отправка человека — на последнем месте. Хотя выполнение первоочередной задачи — всё равно что поиск иголки в стоге сена, учёные полагают, что и...
  (читать дальше)

Как природа осуществляет наноразмерный контроль за солнечной энергией
Начало природного процесса захвата солнечной энергии происходит в абсорбирующих свет протеиновых комплексах, называемых фотосинтетическими реакционными центрами (РЦ). Даже после миллиардов лет эволюции Природа и не думает отказываться от находящегося в центре РЦ абсорбирующего свет гексамерного кофактора, нужного для проведения самой первой химической реакции фотосинтеза — индуцированного светом э...
  (читать дальше)

Почему секс и красный цвет взаимосвязаны
Исследователи пришли к выводу, что красные женские гениталии не возбуждают мужчин — следовательно, для сексуальной символики красного цвета нужно искать иное, менее наглядное объяснение. Обычно поведенческие эксперименты такого рода проводят на млекопитающих. Поэтому то, что в исследовании участвовали не самцы обезьян, а обычные мужчины, добавляет результатам ещё и солидную долю пикантности. С...
  (читать дальше)

Как мысли о смерти нам жить помогают
Размышления о смерти делают нас добрее и внимательнее, а вид на кладбище способен помочь с пошатнувшимся здоровьем. Общество обычно табуирует тему смерти. Считается (и тому есть подтверждения в работах психологов), что мысли о смерти негативно влияют на психику, способствуют асоциальному и даже антисоциальному поведению, и что нормальной жизни «размышления о вечном» следует держать в узде. С пси...
  (читать дальше)

Королевство кривых лучей
Обычно свет распространяется по прямой. Конечно, при помощи сред с различными коэффициентами преломления его можно отклонить. Однако новые исследования двух независимых научных групп показывают, что и сам по себе пучок света может изгибаться до 360˚. Часто новое — это хорошо забытое, но не обязательно старое. В конце 1970-х физики Майкл Берри из Бристольского университета (Великобритания) и Нанд...
  (читать дальше)

Объявлены победители конкурса подводной фотографии
Подведены итоги ежегодного конкурса подводной фотографии, который проходит под эгидой Школы морских и атмосферных наук Университета Майами (США). До участия допускаются только любители, которые зарабатывают на фотографии не более 20% своего дохода. Второе место в категории «Макросъёмка»: «фарфоровый» краб из семейства Porcellanidae, зацепившийся за полип морское перо в национальном парк...
  (читать дальше)

Заболевания дёсен, оказывается, не имеют отношения ни к инфарктам, ни к инсультам
Вот уже два десятка лет учёные твердят о связи между заболеваниями дёсен, инфарктами и инсультами. И вдруг новый анализ данных показывает, что эти заявления ошибочны. Американская кардиологическая ассоциация опубликовала в AHA journal Circulation «научный рапорт», заключающий, что периодонтит не повышает риска возникновения сердечно-сосудистых хворей и не является их причиной. Более того, нет ни м...
  (читать дальше)

Аспирин, возможно, помогает против ожирения
Салициловая кислота, образующаяся в результате расщепления аспирина, активирует расщепление жиров в клетке. Кажется, человечество вот уже более полутораста лет живёт с лекарством от всех болезней, не догадываясь о его чудодейственном всемогуществе. Не так давно проходило сообщение о том, что аспирин можно пить для профилактики рака; полным ходом исследуется его благотворное влияние при сердечно-...
  (читать дальше)

Как звучит симметрия субатомного мира?
Хотите услышать песнь позитрона? Итальянский инженер Доменико Вичинанца, кажется, готов воплотить вашу мечту. Этот человек уже экспериментировал с вулканической активностью и даже играл древнегреческую музыку с «Оркестром забытых звуков». Теперь его влечёт субатомный мир туманных и пузырьковых камер — предшественников современных детекторов частиц. Туманную камеру изобрёл в 1895 году шотландск...
  (читать дальше)

Нам бы расписания взять и отменить
Исследователи из Технологического института Джорджии (США) обнаружили, что отмена управления наземным общественным транспортом при помощи расписания и использование децентрализованной самоуправляющейся схемы позволяет сделать движение более эффективным. В работе, опубликованной в журнале Transportation Research, описан алгоритм, позволяющий минимизировать интервалы между появлениями автобусов на о...
  (читать дальше)